"Estudio in silico de la proteína E6 del Virus del Papiloma Humano para el descubrimiento de fármacos antivirales"

Joel Ricci López © 2017
Queda prohibida la reproducción parcial o total de esta obra sin el permiso formal y explícito del autor y directores de la tesis.

Objetivo 1

En esta sección se presenta una breve descripción del método llevado a cabo y los scripts utilizados en el proceso de obtención y análisis de las secuencias de aminoácidos de la proteína E6. Todos los procesos de esta sección fueron realizados en un equipo Aspire R14 Intel® Celeron dualcore 1.50GHz.



Para esta sección no fueron empleados scripts relevantes por lo que sólo se listan las herramientas utilizadas en el transcurso de la investigación.

Resultados

Alineamiento múltiple de secuencias de la proteína E6. Se muestran únicamente las secuencias de aminoácidos de la proteína E6 de los cinco tipos de AR y de BR con mayor incidencia (AR1 y BR1). El color morado señala los sitios con una conservación igual al 100 %, el azul los sitios con una conservación ≥ 50 %, y el magenta sitios con una similitud ≥ 50 %, es decir, residuos con propiedades fisicoquímicas similares. Figura obtenida con el paquete TeXshade (Beitz, 2000)
Fenogramas generados con las secuencias de las proteínas L1 y E6. a): Fenograma construido con las las 21 secuencias de aminoácidos de la proteína L1. La distribución de los grupos es similar al reportado por Villiers et al. (2004). b): Fenograma de la proteína E6. Se observan dos grupos definidos correspondientes a los tipos de alto riesgo (AR) y a los de bajo riesgo (BR), en café y azul, respectivamente. El Betapapillomavirus VPH-49 fue utilizado como grupo externo.
Joel Ricci López © 2017
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